Od akademického roku 2004/2005 přecházejí fakulty VŠCHT Praha na nový moderní a flexibilní systém vzdělávání, plně kompatibilní s evropskými vzdělávacími standardy. Jeho podstatou jsou tři postupně navazující stupně vysokoškolského vzdělávání - bakalářský, magisterský a doktorský stupeň. Je tak vytvořen model studia, který naplňuje oba požadavky kladené na bakalářské studium – připravit studenty k výkonu povolání a vytvořit předpoklady k dalšímu studiu v nově koncipovaném, krátkém magisterském studijním programu.
Nový systém plně implementuje hodnocení studia pomocí kreditního systému a umožňuje snadné zapojení VŠCHT Praha, jejich studentů a absolventů do celoevropského systému vysokoškolského vzdělávání. Studium na VŠCHT Praha přitom zároveň vychází ze svých dlouholetých tradic a významu pro celou řadu oborů chemického a potravinářského průmyslu a silného vědeckého a výzkumného potenciálu.
Z toho důvodu jsou od akademického roku 2004/2005 uchazeči přijímáni ke studiu pouze v tříletých bakalářských studijních programech. Absolventi nových bakalářských studijních programů mohou pokračovat ve studiu ve dvouletých navazujících magisterských studijních programech a dále v tříletých doktorských programech.