Prosím čekejte...
Nepřihlášený uživatel
logo VŠCHT
iduzel: 30011
idvazba: 38199
šablona: api_html
čas: 9.8.2020 20:16:56
verze: 4671
uzivatel:
remoteAPIs: https://cis-web-test.vscht.cz/studijni-system/
branch: trunk
Obnovit | RAW

Chemoinformatika

Přednáška Cvičení/laboratoř
2019, letní semestr
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
Po
Út
St
Čt
Examinace zkouška
Jazyk výuky čeština
Úroveň doktorský předmět
Garant doc. Mgr. Daniel Svozil, Ph.D.

Anotace

Předmět pokrývá základní techniky správy a analýzy chemických dat v počítači včetně reprezentace 2D a 3D
chemických struktur, vyhledávání v chemických databázích, popis algoritmů a aplikací jako např. shluková a
diverzitní analýza, kvantitativní vztah mezi biologickou aktivitou a strukturou látky (QSAR), virtuální screening,
prediktivní modelování a vytěžování znalostí z dat.

Sylabus

1) Úvod do chemoinformatiky
2) Reprezentace 2D struktur v počítači, charakterizace 2D struktur pomocí deskriptorů a fingerprintů
3) Algoritmy pro 2D prohledávání chemických databází, reprezentace chemických reakcí
4) Chemické souborové formáty a SMARTS
5) Reprezentace a vizualizace 3D struktur, zarovnávní
6) Shluková a diversitní analýza
7) Kvantitativní vztah mezi biologickou aktivitou a strukturou látky (QSAR)
8) Virtuální screening
9) Prediktivní modelování
10) Dokování a skórování
11) Faramakoforové modelování
12) Vytěžování znalostí z biologických a chemických informací
13) Analýza HTS dat
14) Počítačový návrh léčiv založený na struktuře a na ligandech

Literatura

Literatura
Z: Leach A. R., An Introduction to Chemoinformatics, Springer, 2007, ISBN 1402062907


VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum

VŠCHT Praha
na sociálních sítích
zobrazit plnou verzi