Chemické báze dat
Přednáška
Cvičení/laboratoř
2020,
letní semestr
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
Po
Út
St
Čt
Pá
| Kredity | 2 |
| Rozsah | 0 / 2 / 0 |
| Examinace | KZ |
| Jazyk výuky | čeština |
| Úroveň | bakalářský předmět |
| Garant |
Ing. Jaroslav Šilhánek, CSc. |
Anotace
Chemické báze dat, především báze dat Chemical Abstracts představují naprosto klíčový nástroj pro jakoukoliv systematickou a cílevědomou práci ve všech oborech chemie, biochemie i chemického inženýrství včetně oborů na rozhraní biologie, medicíny, metalurgie i obecně materiálového inženýrství. Dominantní oblastí je pak počítačová reprezentace chemických látek a sloučenin, její principy a systém evidence a důsledky ve všech oblastech chemických informací. Logicky navazující oblastí jsou reakční báze dat se svou specifickou problematikou a problematika chemických patentů, mimořádně důležitá v oblasti farmaceutické chemie a příbuzných oborů. Konkrétní náplň předmětu je průběžně aktualizována v souladu s vývojem nástrojů pro jejich využívání.
Sylabus
1. Chemické databázové systémy, jejich historie, současný stav a budoucnost.
2. Zásadní koncepce zpracovávání chemických informací v klasické i elektronické formě.
3. Chemická látka a sloučenina jako klíčový předmět zpracování v chemických bázích dat.
4. Popisná identifikace chemických sloučenin vzorcem, možnosti takového popisu.
5. Elektronické formy chemických vzorců a jejich grafické representace.
6. Podrobný popis registračního systému chemických látek a sloučenin - báze dat REGISTRY.
7. Báze dat Chemical Abstracts - verze CAonCD, praktické procvičování věcného i strukturního hledání.
8. Obecná problematika strukturních bází dat a jejich přehled.
9. Systém CrossFire a báze dat Beilstein. Procvičování jejich použití.
10. Problematika anorganických sloučenin a báze dat Gmelin. Demonstrace vyhledávání anorganických sloučenin.
11. Báze dat Reaxys a další možnosti práce se strukturním zadáním chemické sloučeniny.
12. Demonstrace programu SciFinder Scholar a jeho webovské verze.
13. Chemické reakční báze dat, obecná problematika a současné možnosti.
14. Strukturní báze dat v oblasti patentových informací, Markushovy vzorce.
2. Zásadní koncepce zpracovávání chemických informací v klasické i elektronické formě.
3. Chemická látka a sloučenina jako klíčový předmět zpracování v chemických bázích dat.
4. Popisná identifikace chemických sloučenin vzorcem, možnosti takového popisu.
5. Elektronické formy chemických vzorců a jejich grafické representace.
6. Podrobný popis registračního systému chemických látek a sloučenin - báze dat REGISTRY.
7. Báze dat Chemical Abstracts - verze CAonCD, praktické procvičování věcného i strukturního hledání.
8. Obecná problematika strukturních bází dat a jejich přehled.
9. Systém CrossFire a báze dat Beilstein. Procvičování jejich použití.
10. Problematika anorganických sloučenin a báze dat Gmelin. Demonstrace vyhledávání anorganických sloučenin.
11. Báze dat Reaxys a další možnosti práce se strukturním zadáním chemické sloučeniny.
12. Demonstrace programu SciFinder Scholar a jeho webovské verze.
13. Chemické reakční báze dat, obecná problematika a současné možnosti.
14. Strukturní báze dat v oblasti patentových informací, Markushovy vzorce.
Literatura
Z: Šilhánek J.: Chemická informatika, Vydavatelství VŠCHT Praha 2002. ISBN: 80-7080-465-3
Z: Panico, R. et al: Průvodce názvoslovím organických sloučenin podle IUPAC. Academia Praha 2000. ISBN:80-200-0724-5.
D: Šilhánek J., Zetková L.: Chemical Abstracts na CD-ROM. Vydavatelství VŠCHT Praha, 1997. ISBN: 80-7080-304-5
D: Ridley, Damon D.: Information Retrieval: SciFinder. Wiley 2009. ISBN: 978-0-470-71247-4.
Z: Panico, R. et al: Průvodce názvoslovím organických sloučenin podle IUPAC. Academia Praha 2000. ISBN:80-200-0724-5.
D: Šilhánek J., Zetková L.: Chemical Abstracts na CD-ROM. Vydavatelství VŠCHT Praha, 1997. ISBN: 80-7080-304-5
D: Ridley, Damon D.: Information Retrieval: SciFinder. Wiley 2009. ISBN: 978-0-470-71247-4.