Martin Schätz spoluautorem článku v prestižním časopise Nature Methods
Moderní biologie dnes stále více pracuje s obrazovými daty – například se snímky buněk, tkání nebo celých organismů pořízenými mikroskopy. Analýza biologických obrazů (bioimage analysis) umožňuje převádět tyto snímky na měřitelná data, díky nimž lze porozumět biologickým procesům, vývoji nemocí nebo účinkům léčby. S rychlým rozvojem zobrazovacích technologií se však analýza těchto dat stává stále složitější a vyžaduje specializované znalosti i mezinárodní spolupráci.
Nový článek „GloBIAS: Strengthening the Foundations of Bioimage Analysis“, publikovaný v prestižním časopise Nature Methods (impact factor přibližně 32), představuje Global BioImage Analysts’ Society (GloBIAS) jako globální komunitní odpověď na tuto výzvu. Publikace popisuje GloBIAS jako celosvětovou, neziskovou iniciativu, která propojuje odborníky na analýzu obrazových dat, vědce, vývojáře softwaru a pedagogy. Na základě mezinárodního průzkumu potřeb komunity článek ukazuje, jak pracovní skupiny, sdílená doporučení, vzdělávání a otevřená podpůrná infrastruktura pomáhají zvyšovat kvalitu, dostupnost a dlouhodobou udržitelnost analýzy biologických obrazů.
Spoluautorem článku je Martin Schätz z Ústavu matematiky, informatiky a kybernetiky, který se podílel na původním sepsání textu i jeho odborné revizi a editaci. Jeho přínos vychází z dlouhodobé praktické angažovanosti: je dobrovolníkem GloBIAS od samotného počátku iniciativy, aktivně působí v pracovních skupinách Communication, Publication a Survey 2024 a zapojil se i do raných otevřených podpůrných aktivit, jako byly GloBIAS Free Help Sessions. Svým autorským i komunitním zapojením tak přispívá k hlavnímu sdělení článku – že silná, otevřená a globálně propojená komunita je klíčem k proměně obrazových dat ve spolehlivé vědecké poznání.
Corbat, A. A., Walther, C. G., de la Ballina, L. R., Condon, N. D., Felder, A. A., Schätz, M., et al. GloBIAS: strengthening the foundations of bioimage analysis. Nat Methods (2026). https://doi.org/10.1038/s41592-026-03060-7